1991年11月4日,国家计划委员会将核工业七九六矿正式列为“八五”三线企事业搬迁单位。1992年9月11日,为尽快摆脱困境,国务院三线办将核工业七九六矿列入国家“八五”三线脱险调整计划。1993年8月21日,中国核工业总公司正式成立了核工业昆仑工业公司。1995年10月23日,为利于核工业七九六矿顺利完成第二次创业,经中国核工业总公司矿冶局同意,3万吨淀粉项目及深加工均由昆仑工业公司负责。1995年12月20日,中国核工业总公司原总经理蒋心雄向原国务院副总理邹家华汇报核工业七九六矿脱险搬迁和昆仑工业公司项目建设时,邹家华欣然提笔写下了昆仑公司名称,以示鼓励。
△蒋心雄视察甘肃昆仑
1996年6月底,蒋心雄到张掖视察项目建设情况,视察后为甘肃昆仑题字。
1999年1月5日,核工业昆仑工业公司更名为“核工业甘肃昆仑张掖生化有限公司”,2003年5月,又更名为“甘肃昆仑生化有限责任公司”,并沿用至今。
经过20多年的发展,甘肃昆仑已成为西北地区工艺先进、技术力量雄厚的现代化玉米淀粉系列产品生产企业,是糯玉米淀粉行业标准的制订单位,主导产品糯玉米淀粉国内市场占有率超过35%,“昆仑雪”牌商标享誉甘肃省内外,现有国家专利13项,年产值6亿元,利税2000多万元,荣获“第一批全国农产品加工示范企业”、“甘肃省农业产业化重点龙头企业”、“甘肃省高新技术企业”、“全国石油和化工企业环境保护先进单位”等多个荣誉称号,也是江南大学食品学院教学实习基地、河西学院学生实习实训基地。
2021年12月,甘肃昆仑顺利完成“退城入园”,公司发展迎来重大历史性机遇,新的园区全面建成,一条“昆仑大道”联通广阔市场和创新发展机遇,新开发双歧因子系列产品——“福健源、颐健源固体饮料”获得消费者青睐,发展实力强劲,职工获得感、幸福感得到明显增强,企业驶上康庄大道。